在常規的情況下,都是根據每個種植者的特定作物、基質和環境來確定施肥量,前提必須遵循灌溉計劃,往后隨著植物的生長需要;隨時間進行調整。建議灌溉時間和養分施用期限作為建議的起點。
水耕種系統中,灌溉方式可以是手動的也可以是自動的。許多較小的室內和溫室種植者,都根據對基質水分狀態的基本觀察來決定何時澆水及澆多少水。這些包括肉眼可見的,如基材表面的顏色,許多問題在潮濕時會變暗,在干燥時會變淺,通過手指測試來確定基材在表面下方的感覺如何。這些方法主要基于不同類型的生長基質的經驗,對于剛接觸無土栽培的人們來說可能很難。
商業溫室種植者對此把持的更準確,,通常使用的一種方法是在每次灌溉后收集測量滲濾液的量。
瀝濾液是指從生長中的容器底部排出的營養液。大多數商業種植者的目的是每次灌溉的滲濾液/排水量為5%至20%,即從容器、桶、袋子的底部施用于每種植物,排水系統的灌溉量不應超過5%至20%。排水量大于此數量,灌溉時間會減少;排水量較小,會增加體積和頻率。
使用排水量測量方法在滴灌室內花園中尤其有效,生長環境不易受到日照,濕度和溫度的日常變化,除了監控滲濾液量以幫助調整灌溉程序外,系統性檢查對于室內花園也至關重要。尤其是小型滴灌系統,容易使用壓力不足的泵,這就會導致流速差,滴頭堵塞的發生率增加,系統周圍營養素輸送量不均。使用水罐收集和測量系統中每個滴頭,產生營養液的量是確保所有植物受到相同灌溉量的重要過程。經常發現同一系統中植物之間的生長差異,是由于滴灌系統中灌溉量的不均衡所致。